Единственным владельцем ООО «Коммерсантъ холдинг» стал бизнесмен Алишер Усманов, посмотрели "Ведомости" данные «СПАРК-Интерфакс». До этого издательским домом владела кипрская компания Kommersant Holding (Cyprus) Ltd., также подконтрольная Усманову. Изменения проведены в связи с законом об иностранцах в СМИ, который вводит ограничение на долю иностранных акционеров в российских изданиях.
В 2006 Усманов выкупил издательский дом у бизнесмена Бадри Патаркацишвили за $200 млн, как говорил он сам. Близкие к сделке источники говорили, что на самом деле сумма была на $100 млн больше.
