Минкомсвязи разместило на сайте реестра производителей отечественного ПО инструкцию для компаний, которым отказали в регистрации. Как говорится в пояснительном документе, отказать обратившемуся могут в двух случаях: если некорректно оформлено заявление, или если "было принято решение об отказе на основании представления подложных документов, или недостоверных сведений". В обоих случаях заявитель имеет право повторно подать заявку, устранив нарушения.
Экспертный совет Минкомсвязи как минимум один раз отказывал компании, обратившейся с заявкой о внесении ее продуктов в реестр. В марте 2016 года в регистрации было отказано поставщику облачных офисных решений «Новые коммуникационные технологии» (бренд «ИволгаПро»), который, по мнению экспертов, оказался связан с латвийской Ascensio CIA (бренд OnlyOfice).
В начале июля 2016 года компания-локализатор антивируса ESET «Исет Девелопмент» подала иск на Минкомсвязи в Арбитражный суд Москвы требуя предоставить официальное обоснование отказа включить ее продукцию в реестр. «Исет Девелопмент» подала заявку в январе 2016 года и не дождалась ответа.
Участники рынка ранее упрекали Минкомсвязи, что процедура принятия решений членами комиссии непрозрачна, а также не прописана процедура апелляции. Появившееся разъяснение показывает, что всем получившим отказ компаниям гарантируется возможность оспорить решение. Однако сроки и процедура такой апелляции в документе не поясняются.
